Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C0C1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C0C1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C0C1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C0C1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H7C0C1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C0C1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C0C1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C0C1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C0C1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C0C1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C0C1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C0C1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H7C0C1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms