Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBY3A6NI87 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBY3A6NI87 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CBY3A6NI87 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBY3A6NI87 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms