Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms