Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms