Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ISPDA4D126 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ISPDA4D126 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms