Protein–RNA interactions for Protein: A3KN83

SBNO1, Protein strawberry notch homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1A3KN83 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBNO1A3KN83 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBNO1A3KN83 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms