Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM30CPA0ZSE6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30CPA0ZSE6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30CPA0ZSE6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30CPA0ZSE6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM30CPA0ZSE6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms