Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms