Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R4GMQ9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
R4GMQ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
R4GMQ9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
R4GMQ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
R4GMQ9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
R4GMQ9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
R4GMQ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms