Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN6Q9Y6Q1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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