Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUBP2Q9Y5Y2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms