Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
R3HCC1Q9Y3T6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
R3HCC1Q9Y3T6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms