Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHBDD3Q9Y3P4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms