Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REXO2Q9Y3B8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms