Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COQ4Q9Y3A0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms