Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX24Q9Y343 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX24Q9Y343 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms