Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAPPC4Q9Y296 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms