Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC5Q9UQL6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC5Q9UQL6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms