Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4E1Q9UPM8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP4E1Q9UPM8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms