Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHA7Q9UN72 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHA7Q9UN72 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms