Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNMA2Q9UL42 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PNMA2Q9UL42 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms