Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNMA3Q9UL41 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PNMA3Q9UL41 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms