Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF221Q9UK13 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF221Q9UK13 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms