Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MID2Q9UJV3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms