Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSRAQ9UJ68 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms