Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms