Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9Q9P2J2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9Q9P2J2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9Q9P2J2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9Q9P2J2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms