Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD7Q9P2D1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHD7Q9P2D1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms