Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL20A1Q9P218 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms