Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L1Q9P0L9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKD2L1Q9P0L9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms