Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC59Q9P031 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC59Q9P031 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms