Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMCD1Q9NZU5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms