Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DLL3Q9NYJ7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DLL3Q9NYJ7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms