Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC10Q9NYD6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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