Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms