Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMP3Q9NV31 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms