Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTLC3Q9NUV7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms