Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOMER2Q9NSB8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOMER2Q9NSB8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms