Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP2Q9NS61 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms