Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOPORSQ9NS56 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms