Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TULP4Q9NRJ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms