Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CHST12Q9NRB3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms