Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC31BQ9NQW1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms