Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PCDH12Q9NPG4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms