Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCB9Q9NP78 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms