Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms