Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARFGAP3Q9NP61 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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