Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNRC6CQ9HCJ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms