Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX8Q9HC52 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms