Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC2Q9H6S0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC2Q9H6S0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms